Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VimP20152 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VimP20152 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VimP20152 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms