Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms