Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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P01654 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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P01654 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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P01654 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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P01654 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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P01654 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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P01654 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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P01654 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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P01654 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01654 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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P01654 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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P01654 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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P01654 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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P01654 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01654 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01654 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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P01654 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01654 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01654 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01654 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01654 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01654 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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