Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Fam162b-201ENSMUST00000020064 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Trpm3-205ENSMUST00000099566 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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