Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms