Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Fam124b-201ENSMUST00000058748 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 March1-206ENSMUST00000110256 3288 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Plk4-201ENSMUST00000026858 3479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms