Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms