Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rnf217D3YYI7 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rnf217D3YYI7 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rnf217D3YYI7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rnf217D3YYI7 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rnf217D3YYI7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rnf217D3YYI7 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf217D3YYI7 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf217D3YYI7 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf217D3YYI7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf217D3YYI7 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf217D3YYI7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf217D3YYI7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf217D3YYI7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf217D3YYI7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf217D3YYI7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf217D3YYI7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf217D3YYI7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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