Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms