Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Cldn9Q9Z0S7 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Cldn9Q9Z0S7 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn9Q9Z0S7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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