Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms