Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pop7Q9DCH2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop7Q9DCH2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms