Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Zbed3Q9D0L1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zbed3Q9D0L1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zbed3Q9D0L1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zbed3Q9D0L1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zbed3Q9D0L1 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zbed3Q9D0L1 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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