Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Khdc3Q9CWU5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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