Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrbp1Q99PL5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrbp1Q99PL5 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrbp1Q99PL5 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrbp1Q99PL5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrbp1Q99PL5 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrbp1Q99PL5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrbp1Q99PL5 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrbp1Q99PL5 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrbp1Q99PL5 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrbp1Q99PL5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrbp1Q99PL5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrbp1Q99PL5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms