Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39cQ8VE09 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms