Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Card11Q8CIS0 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms