Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Nhlrc3Q8CCH2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
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