Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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