Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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