Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms