Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Clec18aQ7TSQ1 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Clec18aQ7TSQ1 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Clec18aQ7TSQ1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Clec18aQ7TSQ1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Clec18aQ7TSQ1 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Clec18aQ7TSQ1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms