Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtminQ6P9S1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtminQ6P9S1 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms