Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Pkp4Q68FH0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Pkp4Q68FH0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Pkp4Q68FH0 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Pkp4Q68FH0 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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