Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Lrrn1Q61809 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Lrrn1Q61809 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Lrrn1Q61809 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Lrrn1Q61809 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms