Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc1Q60596 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms