Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp48Q3V0C5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp48Q3V0C5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp48Q3V0C5 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp48Q3V0C5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp48Q3V0C5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Usp48Q3V0C5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp48Q3V0C5 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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