Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sec31aQ3UPL0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sec31aQ3UPL0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms