Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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