Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms