Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms