Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms