Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt6aP50446 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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