Protein–RNA interactions for Protein: P20863

Gdf1, Embryonic growth/differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf1P20863 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gdf1P20863 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms