Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prim1P20664 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms