Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms