Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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H2-Eb1P04230 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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H2-Eb1P04230 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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H2-Eb1P04230 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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H2-Eb1P04230 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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H2-Eb1P04230 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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