Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01657 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01657 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01657 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01657 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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