Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01654 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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P01654 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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P01654 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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P01654 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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P01654 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01654 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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