Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TsksO54887 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms