Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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