Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clrn2B2RVW2 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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