Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms