Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms