Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms