Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms