Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpusd4Q9CWX4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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