Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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TrabdQ99JY4 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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TrabdQ99JY4 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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TrabdQ99JY4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrabdQ99JY4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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