Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms