Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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